《黄帝内经》简称《内经》，原为18卷。其中9卷名《素问》；另外9卷无书名，汉晋时被称为《九卷》或《针经》，唐以后被称为《灵枢》，非一人一时之作，主要部分形成于战国时期。注重整体观念，既强调人体本身是一整体，又强调人与自然环境密切相关，运用阴阳五行学说解释生理、病理现象，指导诊断与治疗；把阴阳的对立统一看成是宇宙间万事万物产生、发展、变化的普遍规律。人体在正常情况下阴阳平衡，一旦这种平衡被破坏，就会生病，强调精神与社会因素对人体及疾病的影响及疾病的预防，反对迷信鬼神。全面总结了秦汉以前的医学成就，标志着中国医学发展到理论总结阶段。该书在中国医学有很高地位，后世历代有所成就医家，无不重视此书。部分内容曾被译成日、英、德、法等文字，对世界医学的发展亦产生了不可忽视的影响。
《神农本草经》又称《神农本草》，简称《本草经》、《本经》。非一人一时之作，“神农”为其托名。战国及秦汉医药学家通过对药学资料不断搜集整理，最后成书。分为序例（或称“序录”）1卷，本文3卷。收载药物365种，其中植物药材252种，动物药67种，矿物药46种。涉及病证约170多种，包括内、外、妇、儿等科疾病。该书根据功用毒性的不同，将药物分为上、中、下三品，这是中国药学史上最早的药物分类法。该书为中国现存最早的一部药物学典籍，所收载的大多数药物沿用至今，其功效已为长期临床实践和现代科学研究所证实。书中提出的药物学理论和用药原则大多正确而具有很高的科学价值。该书为中国古代的药物学理论奠定了基础，对后世药物学发展产生了深远影响，至今仍为学习中医药的重要参考书。
《伤寒杂病论》又名《伤寒卒病论》，张仲景著于汉末。书中概括了中医的四诊、八纲、八法，理法、方药齐备，确立了辩证论治原则；以脏腑论内科杂病，兼及妇、外科疾病，共记载40余种疾病，对其病因、病机及诊断、治疗均有精当论述；载方269首，基本概括了临床各科的常用方剂，对方剂的君臣佐使及加减变化已有较高要求，所用剂型已有10多种，积累了丰富的实践经验和较系统的方剂学理论知识。该书为中国医学史上影响最大的著作之一，曾有四五百家对《伤寒杂病论》进行探索，留下近千种专著、专论，形成独特的伤寒学派，自唐宋以来，其影响远及国外。
《千金翼方》孙思邈撰于682年，系作者为补充《千金要方》而编集。卷首为“药录”，辑录药物800余种，详论其性味、主治等，其中有些是唐以前未收录的新药和外来药物。书中对内、外各科病证的诊治在《千金要方》的基础上均有增补，并收载了当时医家秘藏的汉张仲景《伤寒论》内容，选录《千金要方》所未载的古代方剂2000余首。中国刻印或影印本近20版次，日本亦有多种刻印本。
《铜人腧穴针灸图经》又称《新铸铜人腧穴针灸图经》简称《铜人经》或《铜人》。宋王惟一撰。刊于1026年，并刻石于相国寺仁济殿内。系在作者创制的针灸铜人模型基础上编撰的。书中手足三阴三阳经脉和督循任穴的循行、主病及其腧穴部位，参考各家学说予以订正。附经腧穴图。该书总结了北宋以前针灸腧穴的主要成就，流传甚广，对针灸学的发展起了一定的推动作用。1949年后有影印本。
《本草纲目》明李时珍撰写于1578年，初刊于1593年。全书载药1892种，其中植物药1094种，其余为矿物及其他药物，由李时珍新增入的药物就有374种。书中附有药物图1109幅，方剂11096首，其中约有8000多首是李氏自己收集或拟定的。每种药物分列释名、集解、正误、修治、气味、主治、发明、附方等项。书中不仅考正了过去本草学中的若干错误，综合了大量的科学资料，也提出了相当科学的药物分类方法，特别是书中将动物药按“从贱到贵”的顺序排列，记载了动物对生活环境适应的重要资料，说明李时珍具备生物学进化思想。此书曾先后刻印数十次，在中国促进了本草学、生物学研究，在世界上也产生了很大影响，出现英、法、德、日等多种文字的节译本或全译本。其中的一些资料，直接影响达尔文进化论的形成。
《温热论》清叶桂讲授，门人顾景文等据笔记整理而成；《续临证指南》中称为《外感温热篇》；《温热经纬》中称作《叶香岩外感温热病篇》；《医门棒喝》则称《叶天士温热论》。阐明温病发生、发展规律，归纳为“温邪上受，首先犯上，逆传心包”；提出温病发展的卫、所、营、血四个阶段，表示疾病由浅入深的四个层次；叙述辨舌、验齿、辨斑疹等意义。在温病学说的发展上，起了承前启后的作用。现有多种刊本。
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